南宋绍兴初，沧浪亭为抗金名将韩世忠所得，改名“韩园”。韩氏在两山之间筑桥，取名“飞虹”，山上有连理木、寒光堂、冷风亭、 运堂，水边筑濯缨亭，又有梅亭“瑶华境界”、竹亭“翠玲珑”、桂亭“清香馆”诸胜。庆元年间犹存。
明洪武二十四年（1391年）宝昙和尚居南禅集云寺，将妙隐、大云两庵并入。嘉靖十三年（1534年）知府胡缵宗将妙隐庵改为韩蕲王祠。二十五年，结草庵僧文瑛复建沧浪亭。
清康熙中，巡抚王新命于其地建苏公祠。三十四年（1695年）巡抚宋荦 再建沧浪亭。乾隆南巡曾驻跸于此，亭南曾筑有拱门和御道。道光八年（1828年），巡抚陶澍于亭西南建“五百名贤祠”。太平天国战争时，亭遭毁。同治十二年（1873年）巡抚张树声、布政使应宝时重修沧浪亭，并在亭南增建“明道堂”。堂后折西为五百名贤祠，祠南为翠玲珑。亭北为面水轩、静吟亭、藕花水榭。还有闻妙香室、见心书屋、印心石屋、看山楼、仰止亭等。
光绪初，园中犹有僧居。光绪末，被洋务局等借用。民国初，一度借设修志局。1927年，苏州美术专科学校校长颜文樑 受聘为沧浪亭保管员。重修后，美校迁入。苏州沦陷时，日军占据此园，毁坏严重。1954年由市园林管理处接管整修，1955年春节正式开放。
全园景色简洁古朴，落落大方。不以工巧取胜，而以自然为美。所谓自然，一是不矫揉造作，不亡加雕饰，不露斧凿痕迹；二是表现得法，力求山水相宜，宛如自然风景。沧浪亭园外景色因水而起，园门北向而开，前有一道石桥，一湾池水由西向东，环园南去清晨夕暮，烟水弥漫，极富山岛水乡诗意。而园内布局以山为主，入门即见黄石为主，土石相间的假山，山上古木新枝，生机勃勃，翠竹摇影于其间，藤蔓垂挂于其上，自有一番山林野趣。建筑亦大多环山，并以长廊相接。但山无水则缺媚，水无山则少刚，遂沿池筑一复廊，蜿蜒曲折，既将临池而建的亭榭连成一片，不使孤单，又可通过复廊上一百余图案各异的漏窗两面观景，使园外之水与园内之山相映成趣、相得益彰，自然地融为一体，此可谓借景的典范。园内还有五百名贤祠，壁上嵌有五百余人像石刻，运刀细腻，颇值观赏。